배기가스 후처리 시스템의 이상 진단 방법이 제공된다. 상기 배기가스 후처리 시스템의 이상 진단 방법은, 촉매로 유입되는 배기가스의 유량, 농도 및 온도를 측정하여 제1 측정값을 구하는 단계, 상기 제1 측정값과 요소수 분사량을 SCR 1차원 모델에 적용하여 상기 촉매의 후단에서 상기 배기가스의 농도 및 온도를 계산하여 모델값을 구하는 단계, 상기 촉매의 후단에서 배출되는 상기 배기가스의 농도 및 온도를 측정하여 제2 측정값을 구하는 단계, 및 상기 모델값과 상기 제2 측정값의 차이를 계산하여 배기가스 후처리 시스템의 이상을 진단하는 단계를 포함한다.